В комплексе сооружений Флоровского монастыря этот храм считался больничным. Одна из лучших сохранившихся построек Андрея Меленского (Притисско-Никольская, 5).

Деревянная церковь Воскресения Христова, действовавшая при монастырской больнице, сгорела во время пожара 1811 года.

На ее месте в 1824 г. на средства Анны Чернышовой построена новая каменная церковь, которую считают одной из лучших сооружений стиля ампир в Киеве. Архитектор Меленский положил в основу композиции ротонду тосканского ордера, к которой по сторонам добавлены две прямоугольные пристройки. Безукоризненно найденные пропорции делают здание выдающимся памятником архитектуры.

Возле Воскресенской церкви в 1834 г. была похоронена монахиня преподобная Елена (Екатерина Бахтеева), ее могила стала одной из святынь монастыря.

С 1960-х годов в церкви размещались мастерские Укрреставрации. В 1971—73 гг. осуществлена реставрация памятника.

С 1993—94 гг. храм снова принадлежит монастырю.