Древние пещеры Зверинецкого монастыря засыпанные землёй и преданные забвению, были обнаружены в конце ХІХ в. в результате оползня. В 1911 г., сразу после второго открытия пещер, монах Свято-Троицкого монастыря Валентин с позволения митрополита поселился в шалаше возле входа в подземелье. Он помогал археологам, исследовавшим пещеры в начале 1910-х годов. Вскоре образовался скит с братией около 40 человек, первым игуменом стал о.Валентин (умер 10 марта 1917 г., похоронен в склепе возле одного из входов в пещеры).

На холме над пещерами на средства богомольцев было возведено просторное деревянное здание для скита, в котором устроили домовую церковь. Освящение храма в честь Рождества Богородицы состоялось 1 декабря 1913 г. (иногда храм называли Валентиновским). 29 марта 1914 г. освящен придел в честь св.Иоасафа Белгородского. Проектировался также придел в честь св.Серафима Саровского. Здание имело простую архитектуру, было двухэтажным, прямоугольным в плане, храмовую часть венчал небольшой купол. В интерьере находился деревянный резной иконостас. Святынями Зверинецких пещер были найденная во время исследований древняя икона Божьей Матери и подаренные Николаем II образ Спасителя и напрестольный крест. Обитель была подведомственна Киево-Печерской лавре.

Роковым для храма стал взрыв артскладов на Зверинце 6 июня 1918 г. После первых взрывов здание дало трещины. Братия успела оставить помещение и спастись в Лавре. Дальнейшие взрывы привели к разрушению здания скита. Под его обломками удалось разыскать только часть храмовой утвари. Однако жизнь скита не остановилась. Вскоре здесь появилась новая церковь в честь Богоматери "Всех скорбящих Радости" — очевидно, в приспособленном помещении. В августе 1920 г. советские органы зарегистрировали Киево-Скорбищенскую церковную религиозную трудовую общину по адресу: ул. Ломакинская, 12 (сейчас ул. Мичурина). Церковью пользовались православные верующие традиционной "старославянской" ориентации. Однако в 1934 г. коллектив трудовой школы № 81 (находилась неподалеку, на ул. Землянской) пожаловался, что монахи "пытаются проводить антисоветскую работу среди учеников", и 26 ноября 1934 г. президиум горсовета постановил закрыть церковь и передать здание в распоряжение школы.

С конца 90-х годов монастырь на Зверинце являлся скитом Свято-Троицкого Ионинского монастыря.

9 июля 2009 года Священный Синод Украинской Православной Церкви под председательством Блаженнейшего Владимира, Митрополита Киевского и всея Украины, благословил открыть в г. Киеве Архангело-Михайловский Зверинецкий мужской монастырь.

2 августа 2010 года, в день памяти святого пророка Божия Илии и преподобномучеников Зверинецких, архиерейским чином было совершено освящение накупольных крестов храма всех преподобных Зверенецких. Чин благословения и освящения крестов совершил Преосвященнейший Александр, епископ Переяслав-Хмельницкий. Разделить с братией молитвенную радость пришли и прихожане монастыря. После освящения кресты были установлены на купола монастырского храма.

9 октября 2012 года Блаженнейший Митрополит Киевский и всея Украины Владимир совершил чин освящения и Божественную литургию в храме в честь всех преподобных Зверинецких. Его Блаженству сослужили: секретарь Предстоятеля УПЦ архиепископ Переяслав-Хмельницкий и Вишневский Александр, наместник Свято-Троицкого Ионинского монастыря епископ Обуховский Иона, наместник монастыря архимандрит Кассиан (Шостак), насельники Зверинецкой обители в священном сане.

22 декабря 2013 года управляющий делами УПЦ митрополит Бориспольский и Броварской Антоний совершил чин освящения храма во имя святителя Иоасафа Белгородского и священномученика Иоасафа (Жевахова).

Действующие храмы: древний пещерный в честь Архангела Михаила, над входом в Зверинецкие пещеры - в честь всех преподобных Зверинецких; храм в честь иконы Божией Матери "Всех скорбящих Радость"; храм во имя святителя Иоасафа Белгородского и священномученика Иоасафа (Жевахова).

Престольные праздники: Рождество Богородицы (8 / 21 сентября), икон Божией Матери «Скоропослушница» (9 / 22 ноября) и «Всех скорбящих Радость» (24 октября / 6 ноября), Чудо Архангела Михаила (6 / 19 сентября) Собор Архангела Михаила (8 / 21 ноября), свт. Иоасафа Белгородского (10 / 23 декабря) сщмч. Иоасафа Жевахова (22 ноября / 5 декабря), дни памяти прпп. Зверинецких: Собор всех прпп. Зверинецких (в неделю 5‑ю Великого поста); Собор прмчч., от половцев убиенных — 20 июля/2 августа; Михаила, митр. Киевского — 30 сентября/13 октября; Михаила, еп. Юрьевского и Лазаря, еп. Переяславского — 6/19 сентября; Мины, еп. Полоцкого — 20 июня/3 июля; Леонтия, еп. Ростовского — 23 мая/5 июня; Климента, игум. Зверинецкого — 25 ноября/8 декабря; Мануила, игум. Зверинецкого — 17/30 июня; Маркиана, игум. Зверинецкого — 25 октября /7 ноября; Софрония, игум. Зверинецкого — 11/24 марта; Андроника Печерника — 17/30 мая; Иоанна Преподобного — 24 июня/7 июля; Феодора Калики — 17 февраля/2 марта.

Святыни: Чтимые иконы Божией Матери «Зверинецкая», «Скоропослушница» и «Всех скорбящих Радость». Мощи прпп. Феодора, Климента и Андроника Зверинецких.

Наместник — епископ Иванковский Кассиан (Шостак).

Богослужение ежедневное. Вечернее, 17.00. Литургия, 7.30 (воскресенье — 7.45). Акафисты: «Скоропослушнице» — четверг, 18.30, «Всех скорбящих Радосте» — воскресенье, 12.00, Архангелу Михаилу — воскресенье 17.00.

Воскресная школа: занятия проходят по воскресеньям, сразу по завершении Божественной Литургии, в чайной монастыря.

При монастыре проводятся "Духовные беседы о Православии" в 19:00 каждые воскресенье и среду.

Адрес: 01014, Киев, ул. Мичурина, 22. Тел. 285‑24‑40.

Проезд: от Метро «Дружбы Народов» — трол. 43 до ост. «Ул. Струтинского».

Веб-сайт: zvcaves.com.ua