У Центральной клинической больницы более, чем 100-летняя история. 24 октября 1874 г. была открыта больница для бедных, которая строилась по инициативе состоятельных киевлян на пожертвования общественности (средства собирали 10 лет). В 1875 г. больница получила имя цесаревича Александра — будущего императора Александра III (в память его чудесного исцеления).

В 1893 г. Городская Дума утвердила предложение председателя Купеческого Собрания Михаила Парфениевича Дегтярева о построении больничного храма. М. П. Дегтярева избрали церковным старостой. 18 июня 1895 г. храм был освящен. А в нем было три престола: центральный — во имя свт. Михаила, приделы — во имя правв. Захарии и Елизаветы (пам. 5/18 сентября) и блгв. кн. Александра Невского (пам. 23 ноября/6 декабря и 30 августа/12 сентября). Колокольня построена в 1898 г. Останки супругов Михаила и Елизаветы Дегтяревых покоятся в храме.

После революции больницу национализировали, а в 1922 г. переименовали в честь Октябрьской революции. На Пасху 1930 г. разрушили храм. Уцелели только фундамент и цоколь. Соседнее здание церковной конторы и трапезной превратили в партком больницы.

Богослужение возобновилось 4/17 декабря 1995 г., в день памяти вмц. Варвары.

Завершено восстановление разрушенного храма.

21 октября 2012 года при храме святителя Михаила, первого митрополита Киевского, состоялось официальное открытие подворья Пантелеимоновского на Афоне монастыря. В честь этого события пребыла великая святыня Пантелеимоновского монастыря на Афоне - честная глава великомученика и целителя Пантелеимона. 

4 апреля 2017 года Священный Синод УПЦ, после обращения Собора старцев святогорской обители, принял решение о временном прекращении деятельности подворья афонского Пантелеимоновского монастыря в городе Киеве.

Святыни: Частица Животворящего Креста Господня. Частица Ризы Господней (в Алтаре). Иконы с частицами мощей многих свв., в т. ч. мч. Стратилата Иверского, Драндского и и прмц. Елизаветы. В храме поддерживают добрую традицию: по благословению священноначалия в храм привозят чудотворные иконы Божией Матери (Касперовскую, Боянскую и др.).

Частица мощей великомученика и целителя Пантелеимона в подворье Пантелеимоновского монастыря на Афоне, что при Свято-Михайловском храме.

Престольный праздник - дни памяти святителя Михаила, первого митрополита Киевского (15/28 июня и 30 сентября/13 октября) и прмцц. Елизаветы и Варвары (5/18 июля).

Настоятель - протоиерей Роман Барановский.

Храм открыт ежедневно: с 9.00 до 19.00.

При храме действует община пострадавших от оккультизма во имя свв. Киприана и Иустины.

Сестричество во имя прмц. Елизаветы создано в 1999 г. Главной задачей сестер милосердия является окормление пациентов больницы.

Богослужение: Ежедневное. Вечернее: 16.00. Литургия: 9.00, в воскресенье — 7.30 и 10.00. Водосвятные молебны с акафистом (все — в 14.00): понедельник — Архистратигу Михаилу, вторник — вмч. Пантелеимону, среда — сщмч. Киприану и мц. Иустине, четверг — пред иконой Божией Матери «Неупиваемая Чаша», пятница — вмц. Анастасии Узорешительнице. Молебен о здравии ежедневно, 18.30. Водосвятный молебен: воскресенье, 8.30.

Проезд: Метро «Дворец спорта», «Кловская».

Адрес: 01023, Киев, ул. Шелковичная, 39/1. Тел. (044) 255-15-58.