Храм был построен в 1871–1874 гг. В 1887–1895 гг. пристроены приделы Воскресения Христова и великомученицы Екатерины. Для надзора за внутренним ее устройством была создана специальная комиссия под "августейшим" председательством Великого князя Владимира Александровича. Типичный псевдорусский стиль церкви и колокольни дает определенные основания приписать ее авторство архитектору В. Николаеву.

В 1885 году, среди прихожан Феодоровской церкви возник замысел о расширении здания храма. Любитель искусств и археологии Т. Кибальчич предложил устроить под новыми пристройками подземные святилища: под южным приделом - в честь Гроба Господня (Кувуклии) в Иерусалиме, под северным приделом - копию пещерного храма, созданного святым Климентом Римским в Инкермане. Известно, что рисунки и чертежи святынь были сделаны членом комиссии археологом Т.В. Кибальчичем. В 1887 году из Киево-Печерской Лавры в церковь преп. Феодора Освященного перенесли копию иконы, сделанной из древнего образа Воскресения Христова, который находился в Иерусалиме. Еще много подобных святынь находилась в храме. Тот же Кибальчич привез с Земли Обетованной частицу Животворящего Древа, камни от пещеры Гроба Господня и погребальной пещеры Богоматери, кусочки камней от Вифлеемской пещеры и Маврийского дуба, под которым библейский патриарх Авраам принимал трех путешественников. Таким образом, храм в честь преподобного Феодора Освященного, который в то время располагался в окрестностях Киева, был практически наполнен различными святынями, которые вызывали восхищение и трепет у паломников.

На приходе действовало Лукьяновское дамское попечительство о бедных, содержавшее дневной приют с приходской школой, и школу домоводства. У храма было небольшое кладбище. На перекрестке улиц Овручской и Багговутовской была сооружена часовня с семейным склепом генерала Ф. Пишенкова (в 1905 г.).

Причт Феодоровской церкви заботился и о часовне, построенной в 1890–1891 гг. в память чудесного спасения императора Александра III и царской семьи (17 октября 1888 г. поезд, в котором царь возвращался из Крыма, потерпел катастрофу возле станции Борки под Харьковом, но никто из царской семьи серьезно не пострадал). Эта часовня была разрушена примерно в 1930 г. На ее месте сейчас стоит памятник Ивану Котляревскому (в сквере на перекрестке улиц Мельникова и Герцена). Настоятель Феодоровской церкви основал Макарьевский храм.

Советские органы зарегистрировали приходскую общину в феврале 1921 года. В середине 1920-х годов была передана "обновленцам". В начале 1930-х годов храм был закрыт и около 1935 г. уничтожено вместе с кладбищем (сохранилось лишь одно надгробие). Сейчас на месте церкви — сквер перед жилым домом по ул. Багговутовской, 4.

19 января 2007 г. была совершена первая Литургия на Крещение Господне. В парке, на месте разрушенной церкви, был установлен храм-палатка, в котором совершаются богослужения.

Археологические раскопки в 2008-2009 годах открыли сохранившийся фундамент храма и конструкции подземных святилищ. За время работ из прошлого встали алтарь святителя Климента Римского и алтарь с "пещерой Гроба Господня".

В декабре 2008 года состоялась первая служба в восстановленном пещерном храме святого Климента Римского.

29 мая 2009 года Блаженнейший Митрополит Владимир совершил чин закладки капсулы под строительство восстанавливаемого храма в честь преподобного Феодора Освященного. Его Блаженству сослужили епископ Переяслав-Хмельницкий Александр, секретарь Киевской Митрополии протоиерей Виталий Косовский, а также духовенство столицы.

8 декабря 2013 года викарий Киевской Митрополии епископ Боярский Феодосий после Божественной литургии совершил освящение новых колоколов для храма.

Престольный праздник: День памяти прп. Феодора Освященного (16/29 мая).

Настоятель: иерей Петр Семащук.

Богослужение: Вечернее: пятница, суббота — 17.00. Литургия: суббота, воскресенье — 9.00. Акафист: среда — 14.00 (перед иконой Божией Матери «Неупиваемая Чаша»), воскресенье — 17.00. Молебен с водосвятием: вторник, четверг — 14.00.

Адрес: 04050, город Киев, ул. Багговутовская, 4А. Тел. 483‑20‑01, 483‑20‑15.

Проезд: от Метро «Лукьяновская» — авт. 31 до ост. «Обл. больница»; трол. 6, 18 до ост. «Ул. Багговутовская».

Веб-сайт: feodor-kiev.church.ua